Es un eufemismo por "sexo anal", en el sentido de suponer la penetración vaginal como "ruta principal" y la penetración anal como "ruta alternativa". El término fue muy usado en reportajes radiales donde no se podía ser muy explícito debido al horario protegido para menores; y -si mal no recuerdo- fue acuñado por el humorista Eduardo Javier "Cabito" Massa Alcántara.
Usado así en Argentina
En países como Argentina y Uruguay, la colectora es una vía que absorbe, recoge e integra el tráfico vehicular de un sector a otro más amplio. Esta función se compara con las mujeres que son muy ardientes en las relaciones sexuales y absorben al hombre por completo. Ir por colectora es una forma de decir que se va a tener sexo con una mujer ardiente y absorbente. Es probable que este significado pudiera ser diferente en otros países.